Pier Giorgio Morandi zenei pályafutása kezdetén 10 éven át volt a milánói Scala zenekarának első oboistája. Ezt követően zeneszerzést tanult a milánói konzervatóriumban, majd karmesteri tanulmányokat végzett a salzburgi Mozarteumban Ferdinand Leitner irányítása alatt. A Scalában Riccardo Muti és Giuseppe Patanè asszisztense volt, majd 1987-ben az USÁ-ban tanult Leonard Bernsteinnél és Ozawa Szeidzsinél. Még ugyanebben az évben megnyerte a “Bernstein-díj”-ként is emlegetett Tanglewoodi Versenyt. 1989-ben a római Opera második karmestere lett, 1990-ben pedig elkészítette első lemezfelvételét, Paisiello Don Chisciotte című operáját. 1991 óta rendszeresen visszatérő vendége a Magyar Állami Operaháznak, de volt első vendégkarmester Helsinborgi Szimfonikus Zenekarnál és a stockholmi Királyi Operaháznál, jelenleg pedig a zágrábi Horvát Nemzeti Színház tiszteletbeli első karmestere.
Morandi az olasz operairodalom avatott tolmácsolója, Olaszország, Európa és a nagyvilág valamennyi jelentős operaháza és fesztiválja, köztük a Római Operaház, a miánói Scala, a nápolyi San Carlo Színház, a sevillai La Maestranza, a tokiói Bunka Kaikan, a szöüli Nemzeti Operaház, a Buenos Aires-i Colon, a stockholmi Királyi Operaház, a brüsszeli La Monnaie, a Deutsche Oper Berlin, a Berlini Állami Operaház, a Frakfurti Operaház, a Bécsi Állami Operaház, a New Yorki-i Metropolitan, a Veronai Aréna, a Zürchi Operaház, a Torre del Lagó-i Puccini Fesztivál, a koppenhágai Királyi Operaház, a Seattle-i Opera és a londoni Royal Albert Hall – is vendégkarmesterként üdvözli.
Szimfonikus művekkel olyan zenekarokkal lépett fel, mint a Magyar Rádió Szimfonikus Zenekara, a Budapesti Filharmóniai Társaság Zenekara, a Flamand Rádió Zenekara, a római Santa Cecilia Szimfonikus Zenekar, a veronai Filharmonikusok, a Sanremói Szimfonikus Zenekar, a Fukuokai Filharminukosok vagy a tokiói Filharmonikusok.
A közelmúltban a Rigolettóval tért vissza a Metropolitanbe, a jövőben a Carment, a Toscát, A trubadúrt és az Andrea Chénier-t vezényli a Bécsi Állami Operaházban, valamint A Nyugat lányát Hamburgban és Budapesten.
Művészetét több felvétel őrzi, így a Londoni Szimfonikus Zenekar és José Cura közreműködésével készült Verdi Gála című DVD, Vittorio Grigolóval és Jonas Kaufmann-nal készített CD-k és számos egyéb lemez a Naxos kiadónál.